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RNAのバンドについて

こんばんは。
実験で大腸菌DNAを抽出し、アガロースゲル電気泳動して撮影したところ、バンドが4本でました。

1番上がDNAによるもので、あと3つはRNAによるものだそうですが、その3つが、順にどのRNA(mRNA、rRNAなど)なのか、実験書などを調べたのですが特定できません。

ご存知の方、アドバイスをいただけないでしょうか。

投稿日時 - 2006-07-21 23:30:00

QNo.2290955

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回答(2)

ANo.2

大腸にはプラスミドが入っているのでしょうか
また精製方法は何でしょうか

プラスミドが入っていないのならば、4本は
ゲノムDNA
23SrRNA
16SrRNA
5SrRNA(+分解物など?)
かもしれません
RNAの大部分はrRNAです

投稿日時 - 2006-07-22 10:34:57

補足

染色体DNAの分離と解析を目的とした実験です。プラスミドは入っていません。
リゾチーム処理、SDSによる溶菌、フェノールによるタンパク除去、エタノール沈殿でDNAを分離し、アガロースゲル電気泳動を行いました。
サンプルは4種で、DNAに
1.何も加えない
2.DNase
3.RNase
4.EcoRI+BamHI
を加えたところ、1で4本のバンド、3で1本のバンドが出たため、3本がRNAであるというところまで判明しています。

投稿日時 - 2006-07-22 11:04:43

ANo.1

4本バンドが出たとのことですが、おそらく上3つがDNAのバンドで、一番下がRNAのバンドでしょう。

解説ししますと、1番上がDNAの2本鎖の片方にニックがはいったもの。2番目が、DNAが開環状のもの。3番目が、閉環状のものになると思います。そして4番目が、RNAのバンドだと思われます。

間違いございましたら、ご指摘願います。

投稿日時 - 2006-07-22 00:08:03

補足

ありがとうございます。
ただ、RNaseを用いると下の3本のバンドが消失したので、おそらく教授の言うとおり下の3本がRNAではないかと思うのですがどうでしょうか。

投稿日時 - 2006-07-22 07:28:39

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